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UB基因组学和生物信息学核心位于纽约州生物信息学和生命科学卓越卓越中心的水牛尼亚加拉医疗校园内。我们很自豪能成为纽约西部第一代的下一代排序服务提供商。

升级到Illumina Novaseq!

随着Illumina Novaseq系统的添加,我们的测序能力大大增加。Novaseq拥有四种可用的流动单元选项,每次运行提供6亿和100亿读。除了增加输出外,Novaseq还具有最大48小时的运行时间,允许快速加工生物样本对生物信息结果。

单细胞10x基因组学铬在这里!

我们很高兴宣布我们现在提供的10x基因组学铬平台。该平台专注于单细胞RNA-SEQ,单细胞V(D)J和全基因组链接读取文库,与我们的Illumina序列符相容。有关如何最佳利用这项新技术的更多详细信息,请与我们联系,并进行定价信息。阅读更多关于我们的10x产品, 或者关于10X生物信息学管道在适当的是处理这些数据集。

高吞吐量排序

  • Illumina Novaseq.- Illumina Novaseq的添加允许我们的核心设施从大规模的单销料测序努力到全基因组和Denovo装配项目的任何规模项目。通过我们直接连接到UB的启用计算研究中心,高性能计算集群,我们能够快速处理样本并对研究人员提供及时的结果。
  • illumina nextseq.- 我们产品的新增功能允许我们快速处理RNA-SEQ,CHIP-SEQ和其他类似的实验,这些实验比Novaseq更少,但不仅仅是Miseq。联系我们了解详情!
  • Illumina Miseq.- 该平台专注于更具针对性的测序,朝着较小的基因组和更小的搜索空间调查。这包括扩增子,外壳和细菌16s测序。

生物信息学

工作人员是四个专用的生物信息管理员,帮助促进在我们的设施中测序的研究项目。测序数据的标准分析包括FASTQC质量报告,FASTQ筛选普通污染物,以及测定特异性基因组对准。

  • 单细胞RNA-SEQ- 10X基因组单细胞分析。
  • 全基因组/ exome - 标准(非联系读取)基因组对齐,GATK最佳实践变体调用和变体注释。
  • 芯片SEQ.- 基因组对齐,使用编码标准,峰值呼叫和可视化的质量评估作为我们设施测序的项目的标准分析。
  • RNA-SEQ.- 基因组对准,并且基因的定量和同种型水平表达可以通过该基因和同种型水平表达进行预先成形htseq.或者袖扣算法和数据可视化是可选的通过deseq2.或者腹带
  • mirna-seq.- MiRNA定量对最新的最新情况mirbase.可通过我们的商业许可证获得CLC Genomics Workbenc.H产品。
  • 自定义咨询- 我们欢迎研究项目和商业努力的合作。请与我们联系了解更多详情。
  • 点菜- 可应要求提供各种各样的产品,包括标准基因组对准,适配器修剪,SNP呼叫等。

额外服务

  • QX100液滴数码PCR机(BiORAD)
  • 来自生物标本的核酸提取物
  • 样本QC
  • 实时PCR.

有关更多信息,请在CBI-ubgbc@buffalo.edu联系我们