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州选择UB实验室作为支持识别COVID-19变异的努力的一部分

作者:DAVID J. HILL

发表2021年7月28日,

珍妮弗•苏瑞提斯。
“我们对在纽约西部传播的病毒掌握的信息越多,我们就越能做好准备,做出公共卫生政策决定,在缓解措施和临床决定方面应对当前形势,并保护我们的社区。”
Jennifer Surtees,副教授
生物化学系

纽约州州长安德鲁·m·科莫(Andrew M. Cuomo)周二宣布,UB实验室已被选中,以支持纽约州识别COVID-19变异的努力。

布法罗大学纽约州生物信息学和生命科学卓越中心的基因组学和生物信息学核心是州内五个实验室之一,作为州卫生部的沃兹沃斯中心和外部实验室之间价值2000万美元的测序合作伙伴关系的一部分。

这项努力的目的是在纽约市以外的纽约州普通人群中提取的SARS-CoV-2阳性标本的基因测序,从而以该州目前强有力的基因组/变异监测工作为基础。除监测外,产生的数据将有助于国家了解疾病表现、治疗或疫苗逃避和功效,并将支持其他发现,为公共卫生干预提供信息。

伙伴实验室的测序结果将向纽约州卫生部和共享禽流感数据全球倡议报告。

布法罗大学乐动安卓卫生科学副校长、雅各布医学和生物医学学院院长迈克尔·e·凯恩(Michael E. Cain)说:“布法罗大学很高兴被选中为全州抗击COVID-19的努力做出贡献。”在整个大流行期间,我们的基因组学和生物信息学核心在SARS-CoV-2测序和识别纽约西部的COVID-19变异方面发挥了至关重要的作用。”

布法罗大学的这个项目由雅各布斯学院(Jacobs School)生物化学副教授詹妮弗·瑟蒂斯(Jennifer Surtees)领导。苏瑞提斯和她的同事在乌兰巴托的纽约州卓越中心在生物信息学和生命科学一直在进行唯一COVID-19样本的基因组测序在纽约西部,和只在几个实验室在纽约以外的国家————已经测序整个大流行。他们的工作已经在伊利县发现了高传染性的三角洲变种。

瑟蒂斯说:“我们对在纽约西部传播的病毒掌握的信息越多,我们就越能做好准备,做出公共卫生政策决定,在缓解措施和临床决策方面应对当前形势,并保护我们的社区。”他补充说,如果没有大学对基因组学和生物信息学核心的投资,这个项目就不可能实现。

2020年4月,Surtees启动了一个项目,与伊利县卫生部(后者提供了来自covid - 19阳性患者的未鉴定样本)以及布法罗大学基因组学和生物信息学核心合作,在布法罗开展SARS-Cov2基因组测序。她说:“我们在整个大流行期间一直在对SARS-CoV-2进行测序,这使我们能够推断病毒进入伊利县的迁移以及该地区的病毒进化。”

自那以后,乌兰巴托小组扩大了其合作伙伴网络,从卡莱达卫生中心、伊利县医疗中心和KSL诊断中心收到了样本。Surtees说:“这使我们在这一最新倡议中与纽约州合作,以扩大我们的测序能力,处于有利地位。”“我们非常高兴能够通过及时提供公共卫生信息,继续为全州抗击COVID-19大流行的努力做出贡献。”

除了布法罗大学,入选的其他四个实验室分别是纽约州立大学上州医科大学、康奈尔大学、罗切斯特大学医学中心和纽约医学院。